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View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name CSS3
Promoter Sequence

No match found!
>CSS3    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
GCTCATTTAATATTAGGTATTTTGCCCATGTCATTTTTGTGCAAGTCATTTTCTCCTTTG
GAACTAAATTTTCTTTAAAATATCTCATATACAAAAAATCCTAACTCACAAGTTAATGTT
TTCCATCATAAGTAGACGTTTATTTAAAACATGTTATTATATATTGATCCACTCTTTGCA
GTGTCGTTTTCCTACAAAAATTAGATACTTAATCTTGAGGAGTGTAGAAATAAGTGAAGG
CGACATAAAGATAGAGAAACAGCCATGAAATTTAGTGAAAGCTGACACTCAAGAATTAGG
AATGTAATAAGATAATGAATCACAACATATAAAATGGAAAGTGAAGTAATAATACTATTC
TATAGAATAATCGACGATCCTTCATGAATTGCTATATATCTGAGGAGAACTTCTAGCATA
TCCTGCATACCTAATATTATAGCCTTCAATAATAATGAAAATCCTAACAATTATCCAATT
ATTCACCAAATTCTCTATTTCAACAGTAGTATTATGGCATTGATTATATTGCAAGCTATA
GATTCGATTTCATGAATTCATAACACTCTAAAAGAGAACTTCTGCAATACTCTGTACAAA
TAACATTATTACTTTTACTAAAAATAGATTTCCGGACACTAACTTTTGAATTCTTATCAA
AGCAGTCGAATGCCGCGTCCTACGGTTTATGTATATAGATTTAAAAATACACGTTAAAGA
CTGTTTTCTCCATAATTCTTGTTTAATATACCTATGAACATAAGCGAGTCAATCAAACTC
GGGAGTAAAATGCTTTAAGGCACGCCGCTTAACCTTTTAAAATACATGTCTGAACATTAT
GTAACCAAACTAAAATTGCTTTTAAATGGATCCGCGCAATATCTAAAAACATTAACTATA
AAGGATAAAAATTTTGGACAAAAAATAGCAGTAGCATGTTTGCTTCCTAAGCGTTTGAAG
TCAAAACCATTTTTAAAAGGGTAGAGAGGCTTAGTAAAAA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
MGCN{9}MGS: -607
>CSS3	Upstream Sequence Complementary Strand
CGAGTAAATTATAATCCATAAAACGGGTACAGTAAAAACACGTTCAGTAAAAGAGGAAAC
CTTGATTTAAAAGAAATTTTATAGAGTATATGTTTTTTAGGATTGAGTGTTCAATTACAA
AAGGTAGTATTCATCTGCAAATAAATTTTGTACAATAATATATAACTAGGTGAGAAACGT
CACAGCAAAAGGATGTTTTTAATCTATGAATTAGAACTCCTCACATCTTTATTCACTTCC
GCTGTATTTCTATCTCTTTGTCGGTACTTTAAATCACTTTCGACTGTGAGTTCTTAATCC
TTACATTATTCTATTACTTAGTGTTGTATATTTTACCTTTCACTTCATTATTATGATAAG
ATATCTTATTAGCTGCTAGGAAGTACTTAACGATATATAGACTCCTCTTGAAGATCGTAT
AGGACGTATGGATTATAATATCGGAAGTTATTATTACTTTTAGGATTGTTAATAGGTTAA
TAAGTGGTTTAAGAGATAAAGTTGTCATCATAATACCGTAACTAATATAACGTTCGATAT
CTAAGCTAAAGTACTTAAGTATTGTGAGATTTTCTCTTGAAGACGTTATGAGACATGTTT
ATTGTAATAATGAAAATGATTTTTATCTAAAGGCCTGTGATTGAAAACTTAAGAATAGTT
TCGTCAGCTTACGGCGCAGGATGCCAAATACATATATCTAAATTTTTATGTGCAATTTCT
GACAAAAGAGGTATTAAGAACAAATTATATGGATACTTGTATTCGCTCAGTTAGTTTGAG
CCCTCATTTTACGAAATTCCGTGCGGCGAATTGGAAAATTTTATGTACAGACTTGTAATA
CATTGGTTTGATTTTAACGAAAATTTACCTAGGCGCGTTATAGATTTTTGTAATTGATAT
TTCCTATTTTTAAAACCTGTTTTTTATCGTCATCGTACAAACGAAGGATTCGCAAACTTC
AGTTTTGGTAAAAATTTTCCCATCTCTCCGAATCATTTTT