Yeastract
YEASTRACT+ INESC-ID IST IBB
Home > Search by DNA motif > Result > View in Promoter Contact/Credits     Tutorial     Help

 

Back to top top

View Consensus in Promoter

Warning! Overlapping consensus sequences found in either strands may not be highlighted correctly!
Standard Name YNCQ0001W
Promoter Sequence

Consensus
RGGGG: -861 -860 -238 -202 -201 -200 -97 
>YNCQ0001W    upstream sequence, from -1000 to -1, size 1000
AAATTAATATAATATTAATAAAGTAATTAGTATAAATAAATAATATGAAAATAAAACTTA
ATAAATATATAAATATAGTCCGGCCCGCCCCCCCGCGGCGGGCGGACCCCGAAGGAGTGA
GGGACCCCTCCCTAATGGGAGGGGpan>GACCGAACCCCTTTTTAAGAAGGAGTCCATATATAT
ATATTAATAAAAAAAAGTAATATATATATATATATTGGAATAGTTATATTATTATACAGA
AATATGCTTAATTATAATATAATATCCATATTCATAATTAATTTTTTATATATATATTAT
ATTATAATATTAATTTATATTATAAAAATAATATTTATTATTAAAATATTTATTCTCCTT
TCGGGGTTCCGGCTCCCGTGGCCGGGCCCCGGAATTATTAATTAATAATAAATTATTATT
AATAATTATTTATTATTTTATCATTAAAATATATAAATAAAAAATATTAAAAAGATAAAA
AAAATAATGTTTATTCTTTATATAAATTATATATATATATATAATTAATTAATTAATTAA
TTAATTAATAATAAAAATATAATTATAAATAATATAAATATTATTCTTTATTAATAAATA
TATATTTATATATTATAAAAGTATCTTAATTAATAAAAATAAACATTTAATAATATGAAT
TATATATTATTATTATTATTAATAAAATTATTAATAATAATCAATATGAAATTAATAAAA
ATCTTATAAAAAAGTAATGAATACTCCTTTTTAAAAATAAAAAGGGGTTCGGTCCCCCCC
CTTCCGTATACTTACGGGAGGGGpan>Gpan>GTCCCTCACTCCTTCTTAATTAAATTATCTTAATTA
AATTATCTTAATTAAATTATCTTAATTAAATTATCTTAATTAAATTATCTTAATTAAATT
AAAAGGGGACTTTATATTTATAAAGTAATTATATTATTATTATTATTATTATTTATTTAT
TTTATTTTTATTATTTTATTATATATATTATATATTAATA
Promoter Sequence
Complementary Strand

Consensus
RGGGG: -218 -219 -220 -221 -222 -844 -871 -906 -907 -908 
>YNCQ0001W	Upstream Sequence Complementary Strand
TTTAATTATATTATAATTATTTCATTAATCATATTTATTTATTATACTTTTATTTTGAAT
TATTTATATATTTATATCAGGCCGGGCGGGGGpan>Gpan>GCGCCGCCCGCCTGGGGCTTCCTCACT
CCCTGGGGAGGGATTACCCTCCCCCTGGCTTGGGGAAAAATTCTTCCTCAGGTATATATA
TATAATTATTTTTTTTCATTATATATATATATATAACCTTATCAATATAATAATATGTCT
TTATACGAATTAATATTATATTATAGGTATAAGTATTAATTAAAAAATATATATATAATA
TAATATTATAATTAAATATAATATTTTTATTATAAATAATAATTTTATAAATAAGAGGAA
AGCCCCAAGGCCGAGGGCACCGGCCCGGGGCCTTAATAATTAATTATTATTTAATAATAA
TTATTAATAAATAATAAAATAGTAATTTTATATATTTATTTTTTATAATTTTTCTATTTT
TTTTATTACAAATAAGAAATATATTTAATATATATATATATATTAATTAATTAATTAATT
AATTAATTATTATTTTTATATTAATATTTATTATATTTATAATAAGAAATAATTATTTAT
ATATAAATATATAATATTTTCATAGAATTAATTATTTTTATTTGTAAATTATTATACTTA
ATATATAATAATAATAATAATTATTTTAATAATTATTATTAGTTATACTTTAATTATTTT
TAGAATATTTTTTCATTACTTATGAGGAAAAATTTTTATTTTTCCCCAAGCCAGGGGGpan>Gpan>G/>>GAAGGCATATGAATGCCCTCCCCCCAGGGAGTGAGGAAGAATTAATTTAATAGAATTAAT
TTAATAGAATTAATTTAATAGAATTAATTTAATAGAATTAATTTAATAGAATTAATTTAA
TTTTCCCCTGAAATATAAATATTTCATTAATATAATAATAATAATAATAATAAATAAATA
AAATAAAAATAATAAAATAATATATATAATATATAATTAT